河馬是紫褐色的。皮膚很厚，背部和兩側的厚度可達4-5厘米，呈黑褐色兼赤紫色，光滑無毛，僅在嘴端、耳內側和尾巴上有一些毛。前后肢上各有大小幾乎相等的4趾，趾尖有蹄，其形狀如同扁爪，趾間略微有蹼。

河馬是地球上已經存在很長時間的生物。它們在5500萬年前在地球上行走。河馬的近親是鯨魚和海豚。在非洲，有一些化石可以追溯到大約1600萬年前。對它們已經在許多層面上進行了分析，以使人類對河馬的進化有所了解。但是直到1985年，才有證據表明河馬與豬無關。曾經引起這種印象的是臼齒的形狀。但是，既然已經進行了DNA測試，則沒有證據表明豬與河馬之間存在任何關系。

河馬體軀龐大而拙笨，體長2-5米，包括一條長約35厘米的尾巴；體重1,300-3200千克。但比較矮，四肢特別短，肩高只有140-165厘米，還不及象的一半高。有一個粗碩的頭和一張特別大的嘴，比陸地上任何一種動物的嘴都大，并且足可以張開呈90度角。

河馬嘴里的牙也很大，門齒和犬齒均呈獠牙狀，是進攻的主要武器，下門齒不是向上生長，而是像鏟子一樣向前面平行伸出，長度可達60-70厘米，重量為2-3千克，犬齒的長度也達75厘米左右。